Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EP400Q96L91 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EP400Q96L91 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms