Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

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Length 1,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP47Q96K76 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP47Q96K76 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP47Q96K76 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP47Q96K76 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP47Q96K76 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP47Q96K76 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP47Q96K76 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP47Q96K76 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP47Q96K76 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
USP47Q96K76 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP47Q96K76 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
USP47Q96K76 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP47Q96K76 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP47Q96K76 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP47Q96K76 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP47Q96K76 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP47Q96K76 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP47Q96K76 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP47Q96K76 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP47Q96K76 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP47Q96K76 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP47Q96K76 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP47Q96K76 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP47Q96K76 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP47Q96K76 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP47Q96K76 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP47Q96K76 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
USP47Q96K76 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP47Q96K76 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP47Q96K76 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP47Q96K76 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
USP47Q96K76 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
USP47Q96K76 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
USP47Q96K76 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP47Q96K76 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP47Q96K76 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP47Q96K76 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP47Q96K76 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
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