Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCC12Q96J65 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCC12Q96J65 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms