Protein–RNA interactions for Protein: Q96HW7

INTS4, Integrator complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS4Q96HW7 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
INTS4Q96HW7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms