Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms