Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYTL4Q96C24 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYTL4Q96C24 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYTL4Q96C24 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYTL4Q96C24 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYTL4Q96C24 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYTL4Q96C24 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYTL4Q96C24 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYTL4Q96C24 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYTL4Q96C24 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYTL4Q96C24 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYTL4Q96C24 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYTL4Q96C24 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYTL4Q96C24 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYTL4Q96C24 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SYTL4Q96C24 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms