Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD2Q96BF3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms