Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
USP9XQ93008 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP9XQ93008 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP9XQ93008 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP9XQ93008 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP9XQ93008 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP9XQ93008 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP9XQ93008 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP9XQ93008 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP9XQ93008 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP9XQ93008 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP9XQ93008 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP9XQ93008 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP9XQ93008 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP9XQ93008 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP9XQ93008 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP9XQ93008 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP9XQ93008 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
USP9XQ93008 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP9XQ93008 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP9XQ93008 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP9XQ93008 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP9XQ93008 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP9XQ93008 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP9XQ93008 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP9XQ93008 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP9XQ93008 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP9XQ93008 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP9XQ93008 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP9XQ93008 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
USP9XQ93008 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP9XQ93008 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP9XQ93008 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP9XQ93008 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP9XQ93008 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP9XQ93008 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP9XQ93008 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP9XQ93008 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP9XQ93008 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms