Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRG4Q92954 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRG4Q92954 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms