Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RAD50Q92878 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD50Q92878 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD50Q92878 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD50Q92878 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD50Q92878 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD50Q92878 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD50Q92878 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD50Q92878 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD50Q92878 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD50Q92878 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD50Q92878 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD50Q92878 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD50Q92878 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD50Q92878 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD50Q92878 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD50Q92878 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD50Q92878 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD50Q92878 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD50Q92878 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD50Q92878 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD50Q92878 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD50Q92878 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD50Q92878 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD50Q92878 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAD50Q92878 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD50Q92878 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD50Q92878 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD50Q92878 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAD50Q92878 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms