Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DDX54Q8TDD1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDX54Q8TDD1 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms