Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD1Q8NHV4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms