Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms