Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LINC00301Q8NCQ3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
LINC00301Q8NCQ3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms