Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACBD4Q8NC06 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms