Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI2

RHOT1, Mitochondrial Rho GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT1Q8IXI2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOT1Q8IXI2 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms