Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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TRAPPC6BQ86SZ2 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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TRAPPC6BQ86SZ2 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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TRAPPC6BQ86SZ2 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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TRAPPC6BQ86SZ2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
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TRAPPC6BQ86SZ2 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
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