Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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USP34Q70CQ2 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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USP34Q70CQ2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP34Q70CQ2 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
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