Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIAT1Q6ZQX7 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms