Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRIG3Q6UXM1 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms