Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZBED9Q6R2W3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms