Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
CARMIL1Q5VZK9 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CARMIL1Q5VZK9 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms