Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ECM29Q5VYK3 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms