Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GKAP1Q5VSY0 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.2 ms