Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms