Protein–RNA interactions for Protein: Q30154

HLA-DRB5, HLA class II histocompatibility antigen, DR beta 5 chain, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DRB5Q30154 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DRB5Q30154 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DRB5Q30154 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DRB5Q30154 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DRB5Q30154 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DRB5Q30154 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DRB5Q30154 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DRB5Q30154 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DRB5Q30154 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DRB5Q30154 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DRB5Q30154 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DRB5Q30154 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DRB5Q30154 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DRB5Q30154 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DRB5Q30154 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DRB5Q30154 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DRB5Q30154 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DRB5Q30154 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DRB5Q30154 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DRB5Q30154 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DRB5Q30154 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DRB5Q30154 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DRB5Q30154 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DRB5Q30154 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DRB5Q30154 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DRB5Q30154 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DRB5Q30154 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DRB5Q30154 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DRB5Q30154 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DRB5Q30154 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DRB5Q30154 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DRB5Q30154 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DRB5Q30154 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DRB5Q30154 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DRB5Q30154 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DRB5Q30154 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DRB5Q30154 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DRB5Q30154 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DRB5Q30154 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DRB5Q30154 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DRB5Q30154 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DRB5Q30154 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DRB5Q30154 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DRB5Q30154 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DRB5Q30154 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-DRB5Q30154 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-DRB5Q30154 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-DRB5Q30154 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-DRB5Q30154 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-DRB5Q30154 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-DRB5Q30154 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-DRB5Q30154 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-DRB5Q30154 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms