Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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RTL8BQ17RB0 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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RTL8BQ17RB0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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RTL8BQ17RB0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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RTL8BQ17RB0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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RTL8BQ17RB0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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RTL8BQ17RB0 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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RTL8BQ17RB0 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RTL8BQ17RB0 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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