Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
LAMA3Q16787 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LAMA3Q16787 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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