Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PDK4Q16654 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms