Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC18A3Q16572 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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