Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP6AP1Q15904 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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