Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKIV2LQ15477 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
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