Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SIX1Q15475 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
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SIX1Q15475 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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SIX1Q15475 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SIX1Q15475 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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