Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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BRD3Q15059 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
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BRD3Q15059 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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BRD3Q15059 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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BRD3Q15059 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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