Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
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CHD4Q14839 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
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CHD4Q14839 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
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CHD4Q14839 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
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