Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BECN1Q14457 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BECN1Q14457 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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