Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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GTF2H2Q13888 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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GTF2H2Q13888 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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GTF2H2Q13888 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2H2Q13888 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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