Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RUNX3Q13761 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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