Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
DNASE1L3Q13609 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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DNASE1L3Q13609 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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DNASE1L3Q13609 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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DNASE1L3Q13609 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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DNASE1L3Q13609 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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DNASE1L3Q13609 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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DNASE1L3Q13609 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DNASE1L3Q13609 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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