Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms