Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BFSP2Q13515 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms