Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCIRG1Q13488 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
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