Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LSAMPQ13449 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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