Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TP53BP1Q12888 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms