Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms