Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C2orf54Q08AI8 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C2orf54Q08AI8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms