Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLFN5Q08AF3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms