Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms