Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSME1Q06323 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms