Protein–RNA interactions for Protein: Q05215

EGR4, Early growth response protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR4Q05215 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR4Q05215 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EGR4Q05215 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
EGR4Q05215 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EGR4Q05215 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR4Q05215 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR4Q05215 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR4Q05215 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR4Q05215 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR4Q05215 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR4Q05215 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR4Q05215 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR4Q05215 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR4Q05215 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR4Q05215 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR4Q05215 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR4Q05215 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR4Q05215 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR4Q05215 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR4Q05215 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR4Q05215 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR4Q05215 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR4Q05215 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR4Q05215 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR4Q05215 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR4Q05215 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR4Q05215 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR4Q05215 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR4Q05215 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR4Q05215 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR4Q05215 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR4Q05215 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EGR4Q05215 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EGR4Q05215 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms